巴拿马原住民集中的山区省份如牛口省、大连省、桑布拉斯等地有疟疾发生，市区极少见。偶有出血性登革热、结膜炎等传染性疾病的病例；因气候炎热，成人有湿疹、皮肤方面的疾病。当地尚未发现禽流感疫情。巴拿马城卫生及医疗水平尚可，除急诊外，一般就诊须事先预约，只是当地守时观念差，候诊时间长，诊疗费用高。私立医院挂号费为30-40美元。有正式工作的人员可加入巴社会保险体系，优惠较大，但今年来巴社保局面临财务困难，很难提供名药好药。